电镜样品制备拥有很多常见的方式，但是不管采用的是怎样的方式，都要尽可能地让样品保持原本的状态，同时还要针对微生物样品进行固定和脱水，否则的话样品的保存期限就会大受影响，对于一心想要进行样品制备的人们来说，的确有各种方法。
投影法就是一种常见的方式，一般要求在真空条件下操作，可以使用电子散射能力强的重金属，在样品的表面上进行喷度，对于没有喷度成功的部分就成为样品的投影。另外还有复燃法，这种方法非常简单，简单来说，就是将样品的背景进行渲染，使得背景的颜色变得不再起眼，如此一来便反衬出了样品的样子，它可以让整个检测过程变得更加顺利一些。除了这两种方式以外，还包括了超薄切片法、冰冻蚀刻法，两种方法各有各的优势。
SEM计量被应用于显微镜制作后，便成为了扫描电子显微镜，这种显微镜处于透射电子显微镜和光学显微镜之间，是一种较为常见的观察手段。据了解这种显微镜的视野很大，成像效果也非常好，尤其是在立体成像方面上，的确比普通的显微镜要好很多。
CryoEM也可以被称作冷冻电镜，它是结合了单颗粒分析技术所制作出来的产品，现如今，它的原子分辨率大约3埃，精确度比较高，只不过在分辨率解析方面上却也受到一定的限制，因为在冷冻过程当中可能会影响到小分子量蛋白质的分析工作。
电镜样品制备拥有具体的方法可行，只需要按照具体方式进行操作即可，SEM计量的出现使得显微镜的功能变得日渐强大，而CryoEM在未来发展过程当中仍旧拥有着巨大的挑战，还有很长的一段路要走。
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